Жизнь молодого Муто Кадзуки закончилась в 16 лет, когда, пытаясь спасти незнакомую девушку от ужасного монстра, он пожертвовал собой, приняв коварный удар, предназначавшийся ей. Однако спасенная им красавица оказалась далеко не так проста, какой казалась с первого взгляда — она вернула Муто к жизни, заменив его сердце какуганэ — уникальным сплавом, полученным с помощью алхимии. Главная его особенность заключалась в том, что при появлении у человека инстинкта борьбы металлический шестигранник превращался в уникальное оружие, которому нет равных. Узнав о том, что таинственный монстр оказался одним из гомункулов — ужасных плотоядных тварей, созданных из людей с помощью алхимии — Муто дал клятву защитить от них своих близких и всё разумное, доброе, вечное. Так началась война алхимического оруженосца Муто Кадзуки, его напарницы Цумуры Токико и отрядов боевых алхимиков против глубоко законспирированной организации Хозяев гомункулов, пытающихся подчинить себе мир…