Теневой Лабиринт — величайшая катастрофа, с которой когда-либо сталкивалось человечество. Дезир Арман – один из шести выживших людей. Попытка очистить последний уровень лабиринта провалилась, и теперь мир близится к своему концу. Однако, когда Дезир готовится встретить свою кончину, то, что открывается перед ним — это... мир, что был 13 лет назад?! Дезир возвращается в прошлое, когда он только поступил в самую престижную магическую академию в стране — Хаврион. Он вновь воссоединился со своими дорогими друзьями и готов изменить прошлое, чтобы спасти мир и своих близких. Осталось три года до появления Теневого Мира! Дезиру предстоит изменить прошлое и собрать могущественных товарищей, чтобы спасти…

История Fate/hollow ataraxia происходит через шесть месяцев после событий Fate/stay night, все еще в городе Фуюки. Базетт Фрага МакРемитц, член Ассоциации Магов и Мастер Пятой Войны Святого Грааля, просыпается на четвертый день войны с новым Слугой, Мстителем, и не помнит, что с ним случилось раньше. Она и Эвенджер решили сражаться и выиграть Войну за Святой Грааль. Между тем, Широ Эмия живет мирной жизнью со всеми своими друзьями из Пятой Войны Святого Грааля. После того, как один из его опытов изменил ход времени и пространства, Рин Тосака уезжает в Ассоциацию волхвов в Англии, чтобы разобраться с проблемами. Слуги чувствуют новую опасность, поскольку вскоре после этого появляются темные существа.…